저는 완전히 빈 폴더에서 작업해서 없었습니다.

macOS인지 윈도우 쓰셨는지 기억은 안나는데, 예를 들어 cd ~ 했을 때 node_modules 폴더라든지 npm install 을 했을 때 설치되는 파일이나 폴더가 있다면, 하위폴더에서 npm install 을 하더라도 요 최상위 디렉토리에 설치될 수 있을 거예용.