def draw_winning_numbers():
s = sorted(generate_numbers(6))
bonus = random.randint(1, 45)
i = 0
while True:
if bonus not in s:
s.append(bonus)
return s
break

이렇게는 괜찮나요??

bonus = random.randint(1, 45) 코드까지도 while문 안에 들어가야 합니다. 전체적으로 들여쓰기가 조금 애매하긴 하지만 bonus 처리 코드만 while 안에 들어가면 문제 없을 것 같아요.